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本书主要参考：
《剑桥中国史》 费正清等 中国社会科学出版社
《中国近代史》范文澜 人民出版社
《清史稿》 赵尔巽 中华书局
《清实录》 中华书局
《清圣祖实录》中华书局
《清高宗实录》中华书局
《清穆宗实录》中华书局
《清德宗实录》中华书局
《太平天国革命亲历记》英 伶俐 上海古籍出版社。
《筹办夷务始末》 文海出版社
《北华捷报》
《西学东渐记》容闳 湖南人民出版社
《中国关税沿革史》英 莱特 三联书店
《太平天国文书汇编》中华书局
《太平天国火炮研究》郭存孝
《太平天国史料译丛》王崇武，黎世清编译 神州国光社
《上海法租界史》法 梅朋 傅立德 上海译文出版社。
《李文忠公全集》
《曾文正公全集》
《左宗棠年谱》罗正均 长沙岳麓书社。
《左文襄公全集》台湾文海出版社。
《左宗棠传》美W L 贝尔斯北京紫云文心图书管理有限公司。
《左宗棠全传》 秦翰才 中华书局。
《张文襄公全集》文海出版社。
《骆秉章奏稿》
《丁文诚公遗集》
《岑襄公遗集》
《李鸿章全集》 上海人民出版社
《刘壮肃公奏议》
《太平天国文选》罗尔刚编著 上海人民出版社。
《李秀成自述原稿注》罗尔刚 中华书局。
《平定关陇记略》易孔昭 胡孚骏 刘然亮 台湾文海出版有限公司。
《义和团史料续编》中华书局。
《平回志》杨毓秀 北京出版社。
《甘宁青史略正编》慕寿祺 天津古籍出版社
《中国近代历史纪念》吴忠礼 宁夏人民出版社。
《绿营兵志》罗尔纲，中华书局
《新疆图志》袁大化修
《清季武卫军考述》任恒俊
《湘军志》王闿运 上海古籍出版社。
《固原县志》宁夏人民出版社。
《清末西北回民之反清运动》 高文远，宁夏人民出版社。
《钦定剿平粤匪方略》奕诉 上海古籍出版社。
《李文清公日记》 李棠阶
《御制平定朔漠纪略》
《清朝文献通考》
《钦定大清会典事例》
《清代宫史丛谈》紫禁城出版社。
《英国与世界》 紫禁城出版社。
《清代画院》紫禁城出版社。
《和卓传》穆罕默德 萨迪克 喀什格里。
《俄国人在中亚》
《叶尔羌汗国史纲》
《中国新疆地区伊斯兰教史》陈惠生，新疆人民出版社。
《伊斯兰教苏菲神秘主义》金宜久，中国社会科学出版社。
《大霍加传》
《阿帕克和卓传》
《18-19世纪新疆社会史研究》日佐口透 新疆人民出版社。
《伊斯兰教在中亚》英文
《西域和卓家族研究》刘正寅 魏良弢 中国社会科学出版社。
《中法海战》陈悦 台海出版社。
《中国伊斯兰教百科全书》四川辞书出版社。
《淮军志》王尔敏 广西师范大学出版社。
《淮军史》樊百川 四川人民出版社。
《晚清兵制》罗尔纲 中华书局。
《德国克虏伯与中国的近代化》德 乔伟 天津古籍出版社。
《中国近代化的历程》 史远芹 中共中央党校出版社。
《清季的洋务新政》樊百川。
《第二次鸦片战争》上海人民出版社。
《1895-1912年中国军事力量的兴起》拉尔夫尔 鲍威尔。中华书局。
《中国近代海军史》程志发 解放军出版社。
《十九世纪的德国与中国》德 施丢克尔 三联书店
《中国近代兵器工业档案史资料》
《清季外交史料》王彦威 王亮台湾文海出版社。
《江南制造局记》魏公允，文海出版社。
《洋务运动》上海人民出版社。
《中国火器史》王兆春，军事科学出版社。
《英国在华外交》 英 威妥玛 商务印书馆
《武器和战争的演变》T N 杜普伊军事科学出版社。
《日清战争》日 藤村道生。
《血证-甲午战争亲历记》日龟井兹明 中央民族大学出版社。
《诸马军阀与西北穆斯林社会》徐宪隆 宁夏黄河数字出版社有限公司。
《中国民族史》王钟涵 武汉大学出版社。
《太平天国》美 史景迁 北京理想国时代文化有限公司。
《回民起义》白寿彝 神州国光社。
《基督教与近代中国》杨天宏 四川人民出版社
《教案与晚清社会》 赵树好 中国文联出版社。
《义和团史料》中华书局。
《在中国发现历史》美 柯文 中华书局。
《中国厘金史》罗玉东。
《清光绪朝中日交涉史料》故宫博物院。
《曾胡治兵语录》巴蜀出版社。
《捻军史料丛刊》商务印书馆。
《中国军事经济史》王其坤 解放军出版社。
《八国联军在天津》齐鲁书社。
《清朝的财政经济政策》日 百濑弘 郑永昌译
《清咸，同时期的财政》
《光绪朝东华录》
《中华帝国对外关系史》美 马士 三联书店。
《中国关税沿革史》英 莱特
《同治中兴》美 芮玛丽 房德林译 中国社会科学出版社。
《中国人口》
《中国移民史》葛剑雄 福建人民出版社。
《心灵史》张承志 湖南文艺出版社
题外的话：
实际上为了写这个题材，我看的资料比这份清单多的多，由于最初只是写着玩，只是看到有用的地方，就习惯用手机拍下来，并没有打算提供这份书单，所以很多书，当时我没有特意的去记录下书名，作者和出版社，特别是在一些期刊杂志上的论文，数量是这份书单的好几倍，都没有收录。
由于这些资料大部分都是从各处图书馆借阅的，重新再借一次实在太麻烦，所以我就不花时间去一一列举了，敬请读者谅解，而且我觉得，如果你只要看完了上面这些书，就会知道我说的每一件事的来源，都是有根有据的，所以我觉得这份清单也应该足够了。
当然，观点总是会有分歧的，比如我通过研究得出结论，湘军当时也拥有足够数量的洋枪洋炮这件事，好多历史专业的人就非要和我打笔墨官司，说我的研究不对，他们坚持南京城下的曾国荃最初带去的湘军，用的依然主要是冷兵器刀矛，以及旧式火器鸟枪，抬枪，劈山炮等等，并不是像我所说的那样，以洋枪洋炮为主。
我能够提出很多证据，比如一些书上是这样写的，他们也能从另外一些书上，找出来是那样写的，甚至是同一本书，前面和后面的记载就互相矛盾，貌似是公说公有理，婆说婆有理，但这恰好是我们双方思维方式的不同。
我认为这个世界上所有的事，都必须符合物理学的基本原则，符合客观规律，凡是违反了这条的，不管是哪本书写的，不管其作者如何的有名，那都不是事实。
所以，讨论在南京城下，只剩下一万多有战斗力的湘军，面对装备了两万只滑膛洋枪，又被拜上帝教洗了脑，置生死于不顾的20万太平天国大军，在一场硬碰硬的，没有耍任何花招的战斗中，杀死对方五万人，获得全胜，对于这一事实，我们选择相信史料记载中，胜利的原因是因为湘军拥有了比太平军更先进的洋枪洋炮，同时又采用了正确的战术，还是采纳另外一些记载，认为他们各个都是武林高手，东方不败，修炼了葵花宝典，所以凭着大刀长矛也可以胜利，哪一个结论更可信？结果其实应该是不言而喻的。
从某种意义上说，一个国家的强弱，其实也是国民认知水平高低的问题。就像慈禧太后，她如果有一点点科学素养，就不会相信，义和团真能刀枪不入，也就不会依此作为决策的依据，向列强宣战，最后给国家和民族带来了沉重的灾难。
遗憾的是，百年之后的今天，有很多历史工作者，依然缺乏基本的逻辑判断能力，不知道历史资料其实也是人写的，受制于当时人的价值观，并不是字字珠玑，而是泥沙俱下，鱼龙混杂，需要我们去芜存菁，拨云见日，以科学和常识作为判断标准，对于写史的人来说，最重要的就是选择。
如果没有这份起码的认识，就会写出我们中学课本那个水平，暗示在第一次鸦片战争中，如果大清帝国的官员，发动群众，派三元里的农民去攻打英军，必然会旗开得胜，如果用这样的认知水平来写史的话，历史肯定就会变成了哈哈镜。
这就是我对之前那些批评我的人的回应，也是本书的写作原则，当然，是人就难免有错误，如果你读过我以前的文章，你会发现，从这篇序开始，虽然总的大方向没变，但是细节做了很多修改，因为在上次的写作中，随着资料越读越多，以及一些读者的指正，我发现很多地方还是有瑕疵的，有些地方甚至是错误的，一直就想修改，但却没有时间。
在被封以后，我终于可以静下来思考一下，所以重新动笔写这一版的时候，其实修改很大，但是我相信这一版的观点和史料，能够给即使之前读过的读者，也带来耳目一新的感觉，而且更加扎实可信。为了提高写作质量，我每周只更新一篇。
感谢大家长久以来的支持，你们的鼓励，指正和批评，就是我写作下去的动力，再次发自内心的谢谢大家。