从八角庭院再次进入室内, 一侧是动物馆, 我们去时未开放, 只能在外面远观。里面是石刻动物或和动物有关的神话。这是教皇庇护六世（ 1775 -1799在位）建立的，他要创建一个“石头动物园” 。那个中央被栏杆围起来的地面, 是马赛克画, 画中各种鱼在水里游动。
穿过动物馆后一个红墙的展厅就是缪斯馆，进入之前的过道上, 是古希腊的酒神狄俄尼索斯, 罗马名字Bacchus, 之前多次提到, 身上布满葡萄的。这位酒神是我们此行意大利见过的最为粗壮的版本, 好似李逵。
缪斯馆的正中摆着又一件来自望楼(观景楼)的大理石雕塑, 《残躯》（Torso del Belvedere，观景楼的残躯）。这是让青年时代的米开朗基罗为其艺术魅力倾倒膜拜的古希腊雕像。
这件作品之所以珍贵, 摆放在最抢眼的位置, 皆因这是古希腊的原作，大约创作于公元前一世纪, 而之前看到的八角庭园的拉奥孔和阿波罗, 都是古罗马的, 年代比这个晚, 并且古希腊文明, 一直是古罗马人学习效仿的对象。虽然这件作品只有躯干和两条残缺的大腿，但隆起的肌肉显示出它曾经无比强壮，人们从它后背上雕刻的狮爪印痕判断它很可能是古希腊的大力士赫拉克勒斯。
缪斯馆的名称来自于馆中树立的一圈缪斯女神像。缪斯是古希腊神话中科学、艺术女神的总称。英语Music音乐一词即源于缪斯。欧洲诗人常以她比作灵感与艺术的象征（第六感女神）。缪斯女神的数目不定，有三女神之说，亦有九女神之说。九女神之说为天神宙斯的九个女儿，每人分管从绘画到音乐等诸多艺术中的一种，因她们生于庇厄利亚地方，亦称为庇厄利亚的女神们（pierides）。她们的首领是阿波罗, 下图箭头所指。
《阿波罗与七弦琴》（Apollo Citharede），这部作品另外的名字是Apollo Musagetes（缪斯的领导者阿波罗）。希腊神话中阿波罗是宙斯的儿子，善于演奏七弦琴，并且是9个缪斯的领导者。
阿波罗的左右两边分别是负责舞蹈的缪斯(手拿乐器) 和负责雄辩和叙事诗的缪斯。
这位是负责天文（Muse of astronomy）的缪斯女神, 名叫乌拉妮娅 Urania。
接下来进入圆形展厅。中央的大盆很显眼，据记载是罗马皇帝尼禄（Nero）的浴盆。尼禄是历史上著名的古罗马暴君。浴盆直径4.76米。由一整块紫色云石制成。浴盆后面两座雕像, 其中右边那位, 就是《安提诺乌斯》（Antinous Pio-Clementino）。埃及馆里也有他的雕像。安提诺乌斯是罗马皇帝哈德良的情人，罗马时代著名的美少年，在他生前和死后，哈德良为他制作了“超过1000件雕塑”，这件作品是其中之一。
地板上精美的马赛克是从古罗马遗迹中挖掘并迁移过來的。地板的正中是美杜莎的头部图案；往外一圈是希腊人与半人马的战争。
大厅四周的壁龛里摆着十尊雕像。其中的一些是古罗马时代完整的雕塑作品，另一些，可以根据作品本身的特征辨別出是希腊雕塑的复制品。
圆形大厅之后本应是希腊十字厅, 我们去时没开, 沿着长廊往里走, 两旁摆满了古罗马小型雕塑。
接下来是挂毯室（Gallery of Tapestries；意大利语Galleria degli Arazzi）
挂毯室为长廊展览室，两侧挂着编织于16世纪的挂毯，一共有十九幅，描绘的是耶稣的生平事迹。
挂毯室连接地图室（Gallery of Maps；意大利语Galleria delle carte geografiche）。
地图室是一个长120米的长廊，两侧挂着意大利及周边的各种古地图，天花板非常华丽。地图室是由教皇Gregory XIII于1580年命人绘制地图装饰的。
博物馆二楼长廊展馆的最后一个展馆叫庇护五世馆, 从庇护五世馆前往拉斐尔画室，沿路会经过圣母无染原罪厅。
圣母无染原罪厅 sala dell immacolata 是教宗庇护九世在1854年12月8日宣布了圣母无染原罪的信理后以圣母玛丽亚为主題的系列壁画装饰的。房间中央是弗朗切斯科.波戴斯蒂绘制的历史意义极为深远的作品“宣告圣母无染原罪信理”。这幅画共分为两部分，下面是教宗位于众多的教会人士和贵族中间；上层则是三位一体——圣父、圣子和代表圣灵的鸽子；以及中部先知、天使、圣人和圣经人物簇拥下的圣母玛利亚。房间正中有立圣母像与祭台(箭头所指)。
接下来是重头戏了, 期待已久的拉斐尔房间 Raphael Rooms（Stanze di Raffaello)
拉斐尔房间一共有四间房间，每间房间的四面墙和天花板都画着壁画，其中有两间房间的壁画为拉斐尔作品（签字厅、伊利奥多罗厅），另外两间的壁画为拉斐尔的学生在其去世之后根据他的草稿完成（博尔戈火灾厅、康斯坦丁大厅）。拉斐尔最著名的作品《雅典学院》在签字厅。
拉斐尔画室是梵蒂冈博物馆的精华，如果时间只允许参观两个展厅，那一定是拉斐尔画室和西斯廷圣堂。这里是教皇朱利斯二世的的寝宫、接待室和办公室，教皇当时想装修房间, 25岁的拉斐尔被其老师推荐至此，开始为教廷设计、绘制装饰和壁画。现在提起这个地方，人们早已忘却了它原来主人的名字，而将“拉斐尔”的名字永久地赋予了这里。
拉斐尔从25岁进入教廷工作、26岁成名，到37岁去世，他人生最辉煌的12年一直只在这一个地方工作。拉斐尔·桑西（1483-1520年），著名的美男子。作为与米开朗基罗和达芬奇齐名的文艺复兴三杰之一, 也是文艺复兴时期最有代表性的画家，博取众家之长，并形成了自己的风格, 独具古典精神的秀美、圆润、柔和，代表了当时人们最崇尚的审美趣味，成为后世古典主义者不可企及的典范。
此时人已经多到无处下脚了。拥挤嘈杂加上捂着大猪嘴, 我感觉汗出如浆, 无法呼吸, 本该仔细看的康斯坦丁大厅和伊利奥多罗厅也只能随着人流不由自主地掠过。第三个便是签字厅, 这个厅的四面墙分别是 《圣礼的争辩》（神学主题）、《雅典学院》（哲学主题）、《帕那苏斯山》（诗歌主题）、《三德像》（法学主题）, 全部是拉斐尔所画。其中以《雅典学院》最脍炙人口。
《雅典学院》创作于1509年至1510年间，描绘的是古希腊、古罗马还有拉斐尔所在年代的著名哲学家、科学家共聚一堂的场景。画中最右边几人里, 有一位是拉斐尔本人(箭头所指)。
拉斐尔左边, 背对着观众的是数学家兼天文学家兼音乐家兼一堆其它的什么家的托勒密; 他的左边穿白衣的是意大利建筑师兼画家的布拉曼特。下面弯腰拿圆规的, 一说是欧几里德, 一说是阿基米德。斜倚石台阶的蓝衣老者是第欧根尼。他的左下方, 以手臂撑头的是古希腊哲学家赫拉克利特。
正中两人, 正向观众走来的是柏拉图(以达芬奇为原型) 和亚里士多德。
这位是Pythagoras 毕达哥拉斯。他旁边探着头看他写字的是德谟克里特, 古希腊哲学家, 原子论创始者。
红箭头是苏格拉底。他左边的白富美是Xenophon色诺芬。绿箭头是亚历山大大帝(马其顿国王、西方四大军事统帅之首)。
这面墙的右边墙壁, 拱形壁画是法学主题《三德像》, 在这幅画上方。
雅典学院对面墙壁, 是神学主题《圣礼的争辩》。
拉斐尔画室的第四个房间是火灾厅（又名 波尔哥火灾厅(Room of the Fire in the Borgo)），这里是教皇尤里乌斯二世和教廷法院的会议室，教皇利奥十世将此作为餐厅。
《波尔哥的火灾》是这间火灾厅中四个情节中最复杂的一个。箭头所指是教皇利奥四世，下面一群人在祈求呼救。这是一个神迹故事，公元847年在罗马的波尔哥发生了一场火灾，教皇利奥四世作了祈祷，大火神奇的停止了。
火灾右边这幅画, 是《查理曼大帝的加冕礼 The Coronation of Charlemagne》
火灾左边那副, 是《奥斯提亚战役 Battle of Ostia》, 由拉斐尔的学生们完成, 我没照到。
火灾厅的拱顶，是拉斐尔的老师佩鲁吉诺在拉斐尔来到罗马之前创作的。佩鲁吉诺与达芬奇是同门师兄弟，与波提切利同被邀往梵蒂冈西斯廷教堂作壁画。
天顶画《圣三位一体与使徒 The Holy Trinity and the Apostles》,佩鲁吉诺所作。
教皇朱利叶斯二世让彼得罗·佩鲁吉诺（Pietro Perugino）装饰拱顶。 四个圆形画描绘了天父，基督和他的试探者，三位一体和使徒，最后是正义与恩典之间的基督对天堂的看法。
这位佩鲁吉诺, 拉斐尔的老师, 在前面佛罗伦萨介绍<大卫>的章节里提到过。他的几幅绘画收集在佛罗伦萨美术学院画廊<掠夺萨宾妇女>雕塑所在的展厅。这个展厅是这个美术馆第一个展厅。后面到了西斯廷, 还有一幅他最著名的壁画, 《The Delivery of the key》，耶稣将天国的钥匙交于圣彼得。
为了近距离欣赏这座翡翠百合, 订的旅店离她只有30米。
Gelato是意式冰激凌, 和美式的区别是Gelato的乳脂含量低，大多不超过6%，而美式冰淇淋最低为10%，通常都在15%以上。Gelato大部分选用了牛奶而非奶油，因此脂肪含量少, 口感有牛奶般的顺滑感，更加清爽，而美式更多的是厚重滑腻。制作Gelato时搅拌速度很慢，打入空气比美式冰淇淋少很多，因此质地非常密实，口感也更细。Gelato的口味特别多。佛罗伦萨和罗马有几家店, 号称上百种口味的。我在意大利吃的几个都是最常见的口味, 榛子, 开心果, 甜橙, 是个店就卖的。
圣天使城堡最初由哈德良皇帝于公元123年至139年修建，作为自己的陵墓。后来罗马历代皇帝也埋葬于此。公元6世纪被改建为教皇堡垒。公元590年，罗马发生了严重的瘟疫，教皇格里高利一世在城堡上方看到了天使幻象，不久罗马瘟疫退去，城堡便被命名为圣天使城堡。后来教皇保禄三世给城堡内的房间设置了华丽的装潢，作为避难住所。圣天使城堡还作为过监狱。圣天使城堡与梵蒂冈只有几百米之遥，它与梵蒂冈之间有一条暗道相通，1527年罗马劫难时, 教皇克莱芒七世从圣彼得大教堂逃到这里, 然后被囚禁于城堡里数十天, 差点饿死。
